劳动关系中加班工资的计算方法主要依据《劳动法》及相关规定，以下是具体说明：
一、加班工资的支付标准
1.工作日加班：支付不低于工资的150%的工资报酬。
2.休息日加班：不能安排补休的，支付不低于工资的200%的工资报酬。
3.法定节假日加班：支付不低于工资的300%的工资报酬。
二、计算基数的确定
1.有约定按约定：劳动合同或规章制度明确约定了加班工资基数的，从其约定。
2.无约定按固定工资：若未约定，一般以劳动者正常出勤月工资的固定部分（如基本工资、岗位工资等）作为计算基数，通常不包含绩效、奖金、补贴等浮动部分，但各地司法实践可能存在差异。
3.无法确定时：若前两项无法确定工资标准，按照劳动者前十二个月平均工资计算，实际工作不满十二个月的按实际月工资水平计算。
三、计算公式
1.日工资：月工资收入÷21.75天（月计薪天数）。
2.小时工资：月工资收入÷174小时（月计薪小时数）。
3.具体计算：
工作日加班：加班工资=日工资÷8×加班小时数×150%。
休息日加班：加班工资=日工资×加班天数×200%。
法定节假日加班：加班工资=日工资×加班天数×300%。
四、注意事项
1.工时制度影响：不定时工作制通常不支付加班工资；综合计算工时制需在综合计算周期内总工作时间超过法定标准部分支付加班工资。
2.证据保留：劳动者主张加班工资，需提供加班事实的证据，如考勤记录、加班审批单、工作记录等。
3.时效问题：不同地区对加班工资的仲裁时效规定不同，一般为1年或2年，具体需结合当地司法实践。建议劳动者与用人单位明确约定工资构成和加班工资计算方式，避免争议。若发生纠纷，可向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁维权。